Вместе с ферментами, задачей которых является уборка агрессивных кислородных радикалов, в организме присутствуют ферменты, для которых наличие H2O2 необходимо для выполнения ими своих метаболических функций. К таким ферментам относятся лактопероксидаза и тиреопероксидаза.
1. Лактопероксидаза – гемсодержащий гликопротеин, который обнаруживается в молоке, слюне, слезной жидкости, на слизистой оболочке дыхательных путей. Ее функцией является использование H2O2 для образования гипотиоцианата (OSCN–). Полученный гипотиоцианат способен подавлять бактерии, грибы, паразиты, вирусы, обеспечивает уничтожение кишечных патогенов у младенца, защиту молочных желез и грудного молока.

Реакция, катализируемая лактопероксидазой
2. Тиреопероксидаза (йодидпероксидаза) – еще один фермент, нуждающийся в пероксиде водорода. Этот фермент принимает участие в синтезе тиреоидных гормонов в составе белка тиреоглобулина. При этом он способен катализировать последовательные реакции:
- окисление йодид-ионов до молекулярного йода J2,
- использование J2 как донора атома йода и
- замещение в ароматическом кольце тирозина атома водорода на атом йода в положении С3, или двух атомов водорода на два атома йода в положениях С3 и С5,
- перенос одного йодированного кольца тирозина на ОН-группу другого тирозина с образованием бицикла йодтиронинов (на схеме не показано).

Реакция иодирования тирозина, катализируемая тиреопероксидазой