Внутриклеточная регуляция
Регуляция синтеза пуринов (пуриновых нуклеотидов) происходит по механизму обратной отрицательной связи, т.е. продукт реакции (или совокупности реакций) ингибирует начальные этапы процесса. Для синтеза пуринов такими ингибиторами являются АМФ и ГМФ:
- ГМФ блокирует первые две реакции синтеза ИМФ, а также ИМФ-дегидрогеназную реакцию,
- АМФ блокирует первую реакцию синтеза ИМФ и аденилосукцинатсинтетазную реакцию.

Схема регуляции синтеза пуриновых нуклеотидов
Кроме этого, имеется положительная перекрестная регуляция со стороны АТФ и ГТФ, а именно – как участник реакций каждый из них оказывает стимулирующее влияние на синтез другого нуклеотида. Это заключается в том, что АТФ, принимая участие в ГМФ-синтетазной реакции, облегчает синтез ГМФ. В свою очередь, ГТФ является донором энергии для синтеза АМФ, участвуя в аденилосукцинат-синтетазной реакции.
Пиримидиновый нуклеотид тимидиндифосфат (ТДФ) также блокирует фермент ФРДФ-синтетазу, что снижает синтез ФРДФ, который используется при синтезе не только пуринов, но и пиримидинов.
Лекарственная регуляция
При разработке новых противоопухолевых средств были предложены ингибиторы ферментов:
- ФРДФ-амидтрансферазы – азосерин, диазонорлейцин,
- ИМФ-дегидрогеназы – микофеноловая кислота, 6-меркаптопурин,
- аденилосукцинат-лиазы – 6-меркаптопурин.